海南师范大学档案馆于2014年3月18日在学校综合档案室的基础上成立，为副处级建制单位。档案馆下设办公室、综合档案部、信息开发部、学生档案部四个部门。档案馆馆藏1958年以来学校的各类档案。现馆藏有海南师范大学和海南教育学院2个全宗，包括党群、行政、教学、科研、基建、设备、出版、外事、财会、学生、实物、11个类别。